今日,美国 华盛顿大学(University of Washington)Zhe Li, Shunzhi Wang, Una Nattermann,David Baker等,在Nature Materials上发文,报道开发了一种通用的计算方法,用于在原子级精度下,设计具有预先指定晶格结构的三维蛋白质晶体,并分级约束了系统的自由度总数。
为此,还设计了三对可单独纯化的低聚物,并在混合后自发地自组装成>100µm三维晶体。这些晶体的结构与计算设计模型几乎完全相同,在整体结构和特定的蛋白质-蛋白质相互作用方面,密切对应。晶体晶胞的尺寸,可系统地重新设计,同时保留空间群对称性和整体结构,并且晶体是极其多孔和高度稳定的。
该项方法,实现了高精度的蛋白质晶体计算设计,并在一级序列中,所设计的蛋白质晶体,还编码了结构和组装信息,为生物材料工程提供了强大的平台。
Accurate computational design of three-dimensional protein crystals.
三维蛋白质晶体的精确计算设计。
图1: 分级晶体的设计策略。
图2 ,和I432-1晶体的计算设计和实验表征。
图3:工程晶体性能。
图4:基于所设计的蛋白质晶体,三维3D 金纳米粒子AuNP超晶格的支架Scaffolding。
文献链接
Li, Z., Wang, S., Nattermann, U. et al. Accurate computational design of three-dimensional protein crystals. Nat. Mater. (2023).
https://doi.org/10.1038/s41563-023-01683-1
https://www.nature.com/articles/s41563-023-01683-1
本文译自Nature。
来源:今日新材料
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